未来の日本、レーダーに映らない島に暮らす天才博士ルティシアのクローン少女・ルルと、その保護者・おじじ。偶然島を発見して以来、島に立ち寄るようになった軍所属のサイボーグ兵器・斉藤と心を通わせながら、ルルは島の人々と平和な日々を過ごしていた。ある日、斉藤を追って開発者の鈴木博士が島にたどり着き、ルルと斉藤は窮地に追い込まれるが、そこに巨大なロボットが突然現れて――!?